Het gaat goed met de kweek van Atlantische zalm. Zowel biologische kooi kwekerijen in Europa als Noorse RAS-kwekerijen worden grotendeels duurzaam beheerd, al verschillen de milieueffecten per kweeksysteem.
Bij biologische kweek in open netten is de uitstoot van voedingsstoffen beperkt, maar er blijft een risico op ontsnapping van zalm en verspreiding van ziekten en parasieten. Chemische middelen worden weinig gebruikt en er gelden strenge eisen voor dierenwelzijn, herkomst van het voer en arbeidsomstandigheden. Bij RAS is het risico op ontsnappingen en vervuiling kleiner, maar deze systemen vragen veel energie. RAS heeft de voorkeur door de kleinere impact op het milieu.
Het beheer van beide kweeksystemen wordt als grotendeels effectief beoordeeld. Biologische kwekerijen voldoen aan strenge certificeringseisen en veel bedrijven beschikken daarnaast over extra duurzaamheidscertificaten. Ook de Noorse regelgeving voor zalmkweek wordt als sterk beoordeeld.
Veel biologische zalmkwekerijen beschikken naast hun biologische certificering ook over een ASC-certificering of een andere onafhankelijke duurzaamheidscertificering.