Veel haaiensoorten staan op de rode lijst van bedreigde soorten van de IUCN als kwetsbaar of bedreigd. Van de meeste soorten vertoont het aantal aanlandingen in de Noordzee sinds 1970 een dalende lijn. Haaien worden wereldwijd overbevist en zijn gevoelig voor visserijdruk. Ze groeien namelijk langzaam, hebben een lage vruchtbaarheid en worden pas laat geslachtsrijp. Haaien kunnen erg oud worden. Ze zijn extra gevoelig tijdens de paaiperiode, want dan scholen ze samen.
Haaien worden gevangen als bijvangst bij vrijwel alle visserijmethoden, maar voornamelijk bij drijvende beugen (longlines). Het op grote schaal wegnemen van toppredators uit de voedselketen heeft hoogstwaarschijnlijk impact op het ecosysteem, al is hier bij haaien weinig over bekend.
In de EU is het afsnijden van haaienvinnen sinds 2003 verboden. De regel is echter makkelijk te ontduiken. De Europese Commissie heeft een haaienactieplan opgesteld met maatregelen om haaien beter te beschermen. De internationale visserijmanagementorganisaties erkennen het probleem van haaienbijvangsten, maar nemen nog nauwelijks maatregelen. Volgens ICES moet de visserij op onder andere doornhaai worden gestopt.