Het gaat tamelijk goed met de kweek van blauwe mossel. Mosselen worden gekweekt aan touwen, op palen, op de bodem of op vlotten in zee en kustwateren. Omdat mosselen zich voeden met plankton uit het water zijn geen voer of meststoffen nodig en is de milieubelasting van de kweek over het algemeen laag.
De kweek veroorzaakt nauwelijks afvalstoffen en kan zelfs bijdragen aan het verwijderen van voedingsstoffen uit het water. Afhankelijk van de productiemethode kunnen mosselpercelen zowel positieve als negatieve effecten hebben op de zeebodem en het bodemleven. Vooral bodemkweek kan de zeebodem verstoren. Ziekten en parasieten komen voor, maar grootschalige uitbraken zijn zeldzaam. Ontsnapte mosselen hebben meestal weinig invloed op het milieu, omdat het om een inheemse soort gaat.
Mosselzaad wordt meestal verzameld op natuurlijke mosselbanken, onder andere met mosselkorren, en in sommige gebieden met speciale invanginstallaties. Het verzamelen met invanginstallaties heeft weinig impact op de omgeving. Het opvissen van mosselzaad met mosselkorren veroorzaakt meer verstoring van de zeebodem en kwetsbare habitats, en wordt door Good Fish afgeraden.
Het beheer verschilt per land, maar wordt meestal als grotendeels effectief beoordeeld. Voor sommige landen zijn geen Aquaculture Improvement Programs (AIP‘s) beschikbaar. Daarnaast beschikken verschillende kwekerijen over duurzaamheidscertificeringen, zoals ASC, biologisch of andere onafhankelijke certificeringen.