Het gaat niet goed met het zeebaars bestand. Het paaibestand is nog te klein om als gezond te worden beschouwd, al is de visserijdruk afgenomen.
Geankerde kieuwnetten kunnen zorgen voor bijvangst van kwetsbare soorten, zoals haaien en roggen, zeevogels en zeezoogdieren. De ecologische impact is nog onvoldoende bekend, al is de CO₂-uitstoot laag. Achtergelaten vistuig vormt een belangrijk risico voor het ecosysteem.
De gemengde sleepnetvisserij kan gevolgen hebben voor kwetsbare (ETP) soorten. Er is weinig informatie over teruggooi en sterfte na teruggooi, vooral bij bodemdieren. Ook ontbreken gegevens over de samenstelling van de vangst. De visserij heeft waarschijnlijk een grote negatieve impact op het ecosysteem, met name op de zeebodem. De CO₂-uitstoot is gemiddeld en achtergelaten vistuig vormt een groot risico.
Zeebaars valt niet onder Europese quota, maar de visserij wordt gereguleerd met andere maatregelen, zoals een minimummaat en nationale regels. Maatregelen om bijvangst en schade aan het ecosysteem te beperken zijn slechts deels effectief en monitoring van kwetsbare soorten schiet tekort. De aanpak van illegale visserij is relatief sterk, maar handhaving en het terugdringen van achtergelaten vistuig kunnen beter.